Modalitate de evitare a propagarii unui risc de securitate in tot arealul ce trebuie protejat. In felul acesta, un atac reusit intr-o parte a obiectivului nu va duce la esecul intregului obiectiv. Cea mai simpla forma de compartimentalizare a unei cladiri este incuierea separata a fiecarei incaperi, eventual cu chei separate detinute de persoane diferite. Alaturi de apararea in profunzime, compartimentalizarea contribuie semnificativ la cresterea securitatii.